碘伏和聚维酮碘具有相似性，二者都属于消毒剂，严格意义来讲都是络合的碘，而区别在于碘伏和聚维酮碘各有各自络合剂的成分、适应症以及作用功效。
首先，碘伏是单质碘与聚乙烯吡咯烷酮的不定型结合物，通常呈浅棕色液体。而聚维酮碘则是1-乙烯基-2-吡咯烷酮均聚物与碘的复合物，为黄棕色至红棕色无定形粉末。其次，碘伏适用于外科手术准备或伤口的消毒，可以直接涂抹在皮肤上。聚维酮碘则更适合用于皮肤划伤、灰指甲等表皮损伤的消毒，可以涂抹或敷在受伤的皮肤表面。另外，二者的作用也有一定的区别，碘伏具有一定的杀菌作用，能够有效消灭一些细菌、病毒和真菌。聚维酮碘能逐步释放碘而发挥抗菌作用，对细菌、病毒、真菌、原虫和芽孢都有效，主要用于皮肤、阴道、口腔等感染的治疗，也可用于皮肤消毒、黏膜冲洗。其作用机制是聚维酮碘接触创面或患处后能解聚释放出有效碘，发挥杀菌作用。因此，可以用于治疗灰指甲。若有使用需求，建议根据具体情况合理选用。如果有挫伤或擦伤，可选择碘伏来消毒，若患有灰指甲这类真菌感染引起的皮肤病，则可用以聚维酮碘为主要成分的亮甲复方聚维酮碘搽剂，药液可渗透至甲下吸收，达到深层杀菌、消炎的功效，可有效改善灰指甲引起的甲部病变。
需注意的是，对碘过敏的人群不建议使用碘伏或聚维酮碘来消毒，以免引起过敏反应，降低治疗效果。