胎儿亲子鉴定分为无创亲子鉴定和有创亲子鉴定两种，无创亲子鉴定费用大概需要5000元左右，有创亲子鉴定费用范围大概需要7000-8000元。
孕期做胎儿亲子鉴定，要保证母子安全的情况下进行，鉴定需要抽取羊水，会对母子造成一定的影响，需要前往正规的机构进行鉴定。做胎儿亲子鉴定时，首先需要抽取男方的毛发、外周血或者口腔细胞，进行DNA序列检测，此时费用大概需要500元左右。鉴定时需要抽取胎儿的DNA序列与男方的DNA序列对比鉴定，抽取胎儿的DNA序列通过无创和有创方式进行。无创亲子鉴定需要提取孕妇外周血，通过高通量测序技术，从中提取胎儿的DNA序列，费用大概需要4000-5000元。有创亲子鉴定需要在孕妇的孕中期，抽取胎儿的羊水，检测羊水中胎儿的DNA序列，费用大约要6000-7000元，做有创手术具有导致孕妇感染、流产的可能性，一般建议通过无创亲子鉴定进行检测。
此外胎儿亲子鉴定费用与鉴定的人数有关，如果需要与多个男性同时鉴定，费用自然需要增加，胎儿亲子鉴定的费用还与检测机构有关，司法鉴定需要走司法渠道，费用要比医院的高。