新生儿心脏有杂音可以分两种情况：一种是生理性的杂音；另一种是病理性的杂音，也就是先天性心脏病所引起的心脏杂音。
正常新生儿心跳在120-160次/分，一般不会有明显的杂音。如果出现杂音，可能是生理性的，因为新生儿新陈代谢比较的旺盛，而且他的一些结构在出生后还没有完全闭合，所以这种情况下就会出现心脏的杂音，生理性的杂音主要是观察不用做特殊处理。病理性的杂音由于先天性心脏病所引起的，比如卵圆孔未闭、动脉导管未闭、房间隔缺损、室间隔缺损、肺动脉高压、法洛氏四联症等等。这些先天性的心脏病都会有心脏杂音的出现，一旦新生儿发现了心脏杂音，往往医生会及时和家长进行沟通，然后进行详细的检查之后，再给孩子选择一个合适的治疗方案。
另外需要注意的是，新生儿的母亲尤其在怀孕前三个月如果要是有病毒感染，或者是接触了一些辐射性的物质，这时候会大大的加重先天性心脏病的概率，因此孕期前三个月的保健格外的重要。