灰指甲的治疗需要根据患者的具体病情以及致病菌来对症治疗，可在医生的指导下选用口服药物或者外用药物来治疗。
灰指甲大多是由真菌感染导致的，患者可在医生指导下口服抗真菌药物如特比萘芬、伊曲康唑等。但口服药物可能会给肝功能造成一定损害，建议患者在遵医嘱服药的期间定期进行肝功能监测，根据自身情况合理调整用药。同时还可联合外用药亮甲牌复方聚维酮碘搽剂进行治疗，亮甲牌复方聚维酮碘搽剂是一种治疗灰指甲的专用药，具有很好的杀灭真菌的效果，主要成分为具有抗真菌、消炎效果的聚维酮碘及阿司匹林，聚维酮碘可以释放出有效碘，有效碘是一种对微生物、细菌、真菌等具有很强杀伤力的物质；阿司匹林具有消炎、镇痛的功效，同时，可在患病部位分解出水杨酸，提升药物渗透皮肤的作用，增强亮甲对灰指甲的治疗效果。
此外，患者在联合用药时，需按疗程进行，治疗后也需要注意个人卫生，养成良好的卫生习惯，平时勤洗脚、勤换袜，鞋袜经常暴晒，保持干燥。