慢性肛裂患者大部分先纠正原发便秘或腹泻，或临床局部用药试验性治疗。保守治疗效果不佳者考虑行肛裂切除和（或）内括约肌侧切。急性或初发肛裂可以通过增加纤维和水摄入及坐浴来治愈。排除便秘是首先要治疗的，扩肛治疗适用于不并发盯乳头肥大及哨兵痔的患者。手术适用于有肛裂三联征或非手术治疗无效的慢性肛裂者。