小儿癫痫预后可通过药物控制和手术治疗。
70%以上的小儿癫痫可通过药物控制。部分难治性小儿癫痫可通过手术去除病灶，或其它调控方法来控制。仅有很小一部分患儿找不到固定的癫痫病灶，没有办法手术，药物控制也非常困难，往往这类儿童的预后较差。绝大多数小儿癫痫都可以通过药物或药物结合手术能到很好的控制。
在选择恰当的药物以及给药方式后，通过定期观察，调整药物剂量或新药，对孩子成长发育的影响都能够减少到最低程度。