治疗灰指甲有效的外用药很多，可以选择抗真菌的药物进行治疗。
灰指甲是真菌感染引起来的，一般这种情况的患者大多数都有脚气，也就是足癣。经过脚气或手气传染，迁延日久，导致指甲也发生这种真菌的感染。典型的灰指甲就是指甲增厚。指甲和甲床之间分离，表面比较粗糙，可以看到一些白色粉末状的脱落，也就是指甲变得不结实，治疗灰指甲的有效外用药，需要选择能够有效抗真菌的药物，治疗灰指甲时可以先用温水泡脚10分钟到20分钟，使指甲变软，然后用指甲剪刀去除多余的废甲，并且用这种甲搓在甲面上搓一下，能够把增厚的物质给搓掉，这样药膏就容易吸收了，有利于病情的恢复。要按时的涂抹药物，连续治疗，直至新甲长出来才可以。
指甲的治疗需要长期的过程，如果外用药非常慢，也可以结合口服抗真菌药物，灰指甲具有传染性，所以患者的鞋袜、擦脚布还有洗脚盆，和其他的人要分开使用，防止交叉感染。在治疗期间一定要多吃一些维生素，高蛋白的一些食物，像豆制品，骨类、像鸡蛋，不需要忌口。