灰指甲是由真菌感染引起的甲病变，因此预防灰指甲需要从避免真菌感染开始着手，建议日常生活中保持良好的个人卫生及生活习惯、避免脚部的外伤、多运动提高个人免疫力。
个人卫生和生活习惯方面，要勤洗手洗脚，并正确清洁和修剪指（趾）甲，特别是在接触公共卫浴用品、潮湿环境或他人的鞋袜后，要用温水和肥皂彻底清洁手脚。避免长时间处在潮湿的环境中，可有效避免真菌感染，因为潮湿闷热的环境是真菌生长和繁殖的重要场所，因此保持脚部的干燥可以有效预防灰指甲。脚部外伤若没有得到及时的消毒处理，也比较容易感染致病菌，诱发灰指甲。另外，提高个人的免疫力是降低感染风险的重要举措，可有效避免真菌侵犯，预防灰指甲。若患者已经出现了甲板颜色改变、甲板增厚、萎缩等症状，那么需在医生的指导下通过外用抗菌药物来抑制真菌的繁殖，如亮甲复方聚维酮碘搽剂，该药含有聚维酮碘和阿司匹林，可起到较强的杀灭真菌、抑制真菌再生的作用，同时还能够消除局部炎症，让药效能够渗透甲板，改善病情。
需注意的是，灰指甲是一种传染性较强的皮肤病，为避免灰指甲传染家人，患者所使用的鞋袜、毛巾需专人专用，并积极做好消毒工作，以防交叉感染传给家人。