碘酊是一种消毒防腐剂，可以改善皮肤微生物感染，如细菌、真菌以及病毒感染等情况，但该药的药物浓度较低，不足以杀灭潜伏在甲板下的真菌，其治疗效果没有抗真菌药物好。
灰指甲是一种由真菌感染引起的甲部病变，该病的治疗应以抗真菌药物为主，而碘酊这类消毒防腐剂，属于碘化钾的酒精溶液，单纯用来消毒的效果较好，但它直接用在皮肤粘膜上时，会产生较大的刺激性，并且其浓度通常比较低，很难达到彻底治愈灰指甲的目的，因此不建议用碘酊来治疗灰指甲。灰指甲的治疗，通常建议选用聚维酮碘、特比萘芬等抗真菌药物，其中聚维酮碘作用在患处，能释放出有效碘，具有杀灭真菌、抑制真菌再生的作用，患者可选择含聚维酮碘成分的外用药，如亮甲复方聚维酮碘搽剂，该药不仅含有聚维酮碘，同时所含的阿司匹林能够分解为水杨酸，可起到消炎止痒的作用，改善患者不适症状。除此之外，对于症状相对严重的患者而言，可将外用药和口服药联用，联合治疗的效果会较好。