服用附子具有一定的副作用，由于附子本身带有毒性，服用过度容易导致患者中毒。若单独服用，会造成患者出现身体发麻、口腔灼热、恶心呕吐等症状。
附子属于热性药物，含有乌头碱、去甲基乌头碱等强心、镇痛的生物碱，药性大热、有毒，具有治疗肾阳虚衰、补火助阳、散寒止痛等作用。中医治疗中常搭配甘草、干姜等中药配合服用，以此降低附子含有的毒性。面对寒湿痹痛的人群，医师会开出含有附子的药物，以此驱寒镇痛、调节身体，部分患者服用附子药物出现中毒的副作用，主要是由于附子生物碱兴奋迷走神经及对心脏的毒害作用，致使服用者出现口舌与四肢麻木、心慌、胸闷等现象，此时应多喝温水，加快药物的排泄，或进服生姜或生姜水，降低附子的毒性，如果不及时处理，严重者可出现心律失常、昏迷休克，服药期间不可吃荔枝、辣椒等上火刺激类的食物，避免过度升阳，导致损害身体的可能。
附子一般用于治疗关节疼痛病症较严重的患者，肝火旺盛、口干燥热的人群不可服用。