硼砂是有毒的，可以造成恶心、呕吐、腹泻等，还可以引起皮肤红斑、全身循环系统障碍，甚至导致休克、昏迷等硼酸中毒症状。
硼砂是含硼矿物及硼化合物，通常为含有无色晶体的白色粉末，易溶于水。硼是人体和动植物必须的生长元素，主要以硼酸、硼砂及其与钠、镁、钙形成的络合物三种形式存在。硼砂在酸性条件下以硼酸的形式存在，该物质会在胃酸作用转变为硼酸，由胃肠道吸收。尽管每次摄入量不多，但排出的速度很慢，从而积少成多，最终会在体内蓄积中毒。硼砂对人体多种器官都有毒害，危害消化道酶的作用，使食欲减退，抑制吸收各种营养素，从而加快分解脂肪，体重减轻，急性还会出现呕吐、腹泻、头晕、头痛等症状，甚至出现红斑、循环系统障碍、休克、昏迷等硼酸症。成人中毒的剂量为1～3g，15～20g为致死量；儿童误食5g即可致死，婴儿误食2～3g可致死。100mg/d为慢性硼中毒的最小剂量。
硼砂可以起到清热解毒、消除人体肿痛的功效，常用来配制成外用药或眼药水进行外用，外用要注意严格按照医生的医嘱，避免出现中毒的症状。